হজরত ওসমান একটি কুরআন নকল কমিটি (Syndicate) গঠন করেন এবং নির্ভরযোগ্য ব্যক্তি ও সাহাবাদের সহযোগিতায় সরকারি পর্যবেক্ষণে কুরআন সঙ্কলন করেন, ইহা পূর্বেই বলা হয়েছে। তিনি কতিপয় কপি প্রস্তুত করাইয়া 'তাহার এক এক খণ্ড মক্কা, মদিনা, কুফা, বসরা, দামেস্ক প্রভৃতি প্রাদেশিক প্রধান শহরে প্রেরণ করেন সরকারি হিফাযতে রক্ষিত হইবার জন্য এবং ইহা ব্যতীত পূর্বের বেসরকারি সঙ্কলনসমূহ দগ্ধীভূত করান। তাঁর এই কার্য সাধারণভাবে সকল শহরেই সমর্থন লাভ করে, একমাত্র কুফা ছাড়া। আবু মাসুদ নামক কুফায় এক ধার্মিক ব্যক্তি ছিল, সে দাবি করে, তাঁর নিজ হস্তে কৃত সঙ্কলন নির্ভুল ছিল এবং আয়াতগুলো যখন যেমন নবী করিমের মুখ হইতে নির্গত হয়েছে তখনই সেইভাবে উহাতে লিখিয়া রাখা হয়েছিল। এই সঙ্কলন পোড়াইবার কোনও উপযুক্ত হেতু ছিল না। এই বলিয়া তিনি খলিফার বিরুদ্ধে জোর প্রচারণা চালাইতে থাকেন। খলিফার কার্য ধর্ম-বিগর্হিত, এই ছিল তাঁর প্রচারণার মূল কথা। কুফার জনসাধারণ ছিল স্বভাবত চঞ্চলমতি। তারা আবু মাসুদের এই প্রকার ঘোষণায় মাতিয়া উঠিল এবং খলিফার বিরুদ্ধে দল পাকাইতে লাগিল। তাদের কথা ছিল, যে কাগজে কুরআনের আয়াত লিখিত হয় তাহা পোড়ান মহাপাপ। হজরত আলি যখন খলিফা হইলেন তখন পর্যন্ত ওসমানের বিরুদ্ধে উক্ত কুৎসা রটনা থামে নাই। পরিশেষে হজরত আলি তাহাদের থামাইয়া দেন এই বলিয়া যে, হজরত ওসমান একাকী কোনও সিদ্ধান্ত গ্রহণ করেন নাই, নেতৃস্থানীয় সাহাবাদের পরামর্শ লইয়াই কাজ করেছিলেন এবং তাঁহাদের ভিতর তিনি নিজেও ছিলেন। তিনি আরও বুঝাইয়া দেন, হজরত ওসমানের পরিবর্তে তিনি নিজে যদি ঐ সময় খলিফা থাকতেন তবে তিনিও হজরত ওসমান যেরূপ করিয়াছেন, তদ্রুপ করিতেন।

সাহাবি আবু জর মানুষের ধন-সম্পত্তি সঞ্চয়ের বিরুদ্ধে প্রচারণা চালাইতেন এবং সবকিছু দান-খয়রাত করিয়া দিতে লোকদের উপদেশ দিতেন, এই অপরাধে সিরিয়ার গভর্নর আমির মু'য়াবিয়া তাঁকে খলিফার অনুমতিক্রমে নেদের মরুভূমিতে রেবাজা নামক স্থানে নির্বাসিত করেন, ইহা পূর্বে উল্লিখিত হয়েছে। মু'য়াবিয়ার আশঙ্কা ছিল, পাছে আবু জরের প্রচারণা হইতে ইসলামে সমাজতন্ত্রবাদ (Communistic Movement) শুরু হয়ে যায়। দুই বৎসর পর নির্বাসিত অবস্থায় তাঁর মৃত্যু হয়। আবু মাসুদ তাঁর জানাযা-কার্য সম্পাদন করেন। একজন ধর্মপ্রাণ সাধুর প্রতি এই নিষ্ঠুর আচরণ শুধু মু'য়াবিয়ার বিরুদ্ধেই জনগণের মনে আক্ষেপের কারণ হয় না, পরোক্ষভাবে খলিফার উপরও তাদের আক্রোশ জন্মে।

হজরত ওসমান কা'বা ঘরের চতুষ্পার্শ্বস্থ চতুষ্কোণ প্রাঙ্গণ বাড়াইবার চেষ্টা করেন, কিন্তু পার্শ্ববর্তী জমির মালিকদের প্রবল বিরোধিতায় খলিফার সে চেষ্টা ব্যর্থ হয়। কিন্তু মদিনার মসজিদ সম্প্রসারণের বেলায় কাহারও আপত্তি খলিফা গ্রাহ্য করেন না। যাদের জমি হুকুমদখল করার প্রয়োজন হয়েছিল তারা জমির অস্বাভাবিক মূল্য দাবি করায় খলিফা তাহাদের কারারুদ্ধ করেন। হজরত উমরের সময়ও এইরূপ করা হয়েছিল, যখন লোকেরা তাদের জমি ও কুটিরগুলো অত্যধিক মূল্য দাবি করেছিল এবং এইভাবে মসজিদের আঙিনা বাড়ানোর ব্যাপারে বাধা সৃষ্টি করেছিল। কিন্তু তখন তাহা লইয়া ব্যাপার বেশি দূর গড়ায় নাই। অথচ হজরত ওসমানের বেলায় বিরোধী দল লইয়া মহাকলরবের সৃষ্টি করে।

খলিফার হজ-সংশ্লিষ্ট কোনও কোনও কার্য লইয়াও তাঁর বিরুদ্ধে আন্দোলন সৃষ্টি হয়েছিল, যদিও কার্যগুলো নিতান্তই সাধারণ ব্যাপার ছিল। তিনি মদিনায় কোরবানি সম্পাদন উপলক্ষে দুই একদিন অবস্থান করার সময় সেখানে তাঁবু খাটাইয়াছিলেন। এরূপ নাকি পূর্বে কখনও করা হইত না।
মীনায় ও আরাফাত পাহাড়ে ইতোপূর্বে যে কয় রাকাত করিয়া নামাজ পড়া হইত, হজরত ওসমান তার পর আরও দুই রাকাত নামাজ বেশি পড়ার নির্দেশ দেন এবং তাতে দুই রাকাতে চারটি সিজদা বাড়িয়া যায়। মু'মিন মুসলমানরা এই নির্দেশের বৈধতা সম্বন্ধে প্রশ্ন তুলেন, এই হেতুতে, নবীর সময়ে বা তার পরেও অন্য দুই খলিফার সময় এরূপ করা হয় নাই। হজরত রাসুল হজের ব্যাপারে যে সমস্ত ধর্মীয় কৃত্যের প্রচলন করিয়া যান, হজরত আবুবকর ও হজরত উমরের সময় তাহা অক্ষরে অক্ষরে পালন করা হইত। ফলে ঐ সকল কৃত্যের প্রতিটি ক্ষুদ্রতম আঙ্গিকও যথাযথভাবে পালনের দায়িত্ব জনগণের মনে একটা অতীব শ্রদ্ধাপূর্ণ সংস্কার পরিণত হয়। তার এক চুল ব্যতিক্রমও তারা ভয়ানক গোনাহের কাজ বলিয়া মনে করিত, তা সে ব্যতিক্রম কমের দিকে হউক, আর বেশির দিকে হউক। অর্থাৎ নবী যেরূপ করিতেন তার কম করাও দোষ বেশি করাও দোষ। লোকেরা তাদের দৈনন্দিন জীবনের সকল কাজেও এই প্রকার সংস্কার দ্বারা চালিত হইতে অভ্যস্ত হয়ে পড়িয়াছিল। তাই সাহাবাগণ হজরত ওসমানকে এই নতুন বিধান প্রদানের বৈধতা সম্পর্কে প্রশ্ন করেন। কিন্তু তিনি কোনোও যুক্তিপূর্ণ কারণ দর্শাইতে পারেন নাই। তাঁর জবাবের সারমর্ম এই ছিল যে, তিনি নিজে এটাকে উত্তম মনে করেন।
হজরত ওসমানের কথায় প্রকাশ পায় যে ইয়েমেনের লোকেরা হজ করিতে আসিয়া সুদূরে অবস্থিত তাদের ঘরবাড়ি ও স্ত্রী পরিজনের কল্যাণের জন্য অতিরিক্ত নামাজ পড়িত। তাদের এই কল্যাণকর রীতির উপর ভিত্তি করিয়া তিনি উপরোক্ত আদেশ জারি করেছিলেন। তিনি নিজেও হজের পবিত্র পরিবেশে অতিরিক্ত নামাজ ও প্রার্থনা করার পক্ষপাতী ছিলেন। ব্যাপারটি সামান্য ছিল এবং অহিতকরও ছিল না। তথাপি নবীর আচরিত রীতির খেলাফ বলিয়া তুমুল আন্দোলন উঠে। হজরত আলি, আবদুর রহমান এবং অন্যান্য প্রধান সাহাবাগণও ধর্মীয় ব্যাপারে খলিফার এই প্রকার হস্তক্ষেপে অসন্তুষ্ট হন। স্বয়ং নবীজীর, যিনি ইসলামের প্রবর্তক, পবিত্র বিধানের এই বরখেলাফের ফলে সাহাবা-মহলে খলিফার বিরুদ্ধে একটা দুর্নাম রটে যাহা তাঁর পক্ষে ভবিষ্যতে সমূহ ক্ষতির কারণ হয়েছিল।