১৪০৪ হিজরীতে, বাদশাহ ফাহাদ বিন আবদুল আযীযের আমলে, মসজিদে হারামের ২য় দফা সংস্কার হয়। তিনি মাতাফকে সম্প্রসারিত করেন এবং মাতাফে অবস্থিত অন্য সবকিছু সরিয়ে ফেলেন। ফলে মাতাফে একযোগে ২৮ হাজার লোক তওয়াফ করতে পারে। হাজারে আসওয়াদের কোণ নির্ধারণের জন্য, বড় আলেমদের মতামত অনুযায়ী, মাতাফের শেষ সীমানা পর্যন্ত ২০ সেন্টিমিটার প্রস্থ বিশিষ্ট কাল রং এর পাথর বসানো হয়েছে। আগে এই কোণের চিহ্ন কিছুটা পশ্চিমে, অর্থাৎ রোকনে, ইয়ামানীর দিকে ছিল। পরবর্তীতে সেই চিহ্ন কিছুটা পূর্বদিকে সরিয়ে আনা হয় এবং হাজারে আসওয়াদের কোণ যথার্থভাবে নির্ণয় করা হয়। লোকেরা চিহ্নের উপর দাঁড়িয়ে ভিড় করায় তা নিশ্চিহ্ন করা হয়।

মসজিদে হারামে বর্তমানে ৬ হাজার ৫৫৮টি পাখা আছে। এর মধ্যে কতগুলো পাখা বেশী শক্তিশালী এবং সেগুলো বেশী ঠাণ্ডা বাতাস সরবরাহ করে। এছাড়াও মসজিদে হারামে ৪৫০টি ঘড়ি আছে। এর মধ্যে ২২৫টি ঘড়ি গ্রীনিচ মান অনুযায়ী সময় দেয়, আর অবশিষ্ট ২২৫টি ঘড়ি স্থানীয় আরবী সময় নির্দেশ করে। এগুলো একটা MASTER ঘড়ি দ্বারা নিয়ন্ত্রিত। MASTER ঘড়িটি কম্পিউটার নিয়ন্ত্রিত। মসজিদে হারামের বাইরে ৬০ মিটার উঁচু ৩টি বড় ঘড়ি আছে। সেগুলো তিনটি ভাষায় সময় ঘোষণা করে।

সাফা-মারওয়া পাহাড়ের মধ্যবর্তী মাসআর নীচতলায় ২৮টি এয়ারকুলার দ্বারা গরমের সময় ঠাণ্ডা বাতাস সরবরাহ করা হয় যেন সাঈকারীদের আরাম হয়। ভিড়ের সময়, মাসআর ওপর থেকে আগত লোকদের মসজিদে পারাপারের জন্য ৬টি ওভারব্রীজ তৈরি করা হয়েছে। হজ্জ মওসুমে এগুলো খোলা হয়। এতে সাঈকারীরা বিনা বাধায় ভিড়ের সময় তাদের সাঈ শেষ করতে পারে।

বাদশাহ ফাহাদ বিন আবদুল আযীয, ১৪০৬ হিজরীতে ২৫ মিটার উপরে অবস্থিত মসজিদে হারামের ছাদ নামাযের উপযোগী করে গড়ে তোলেন। এতে তাপ নিয়ন্ত্রণকারী সাদা মার্বেল পাথর বসানো হয়। যার ফলে, মাতাফের মত প্রচণ্ড গরমের সময়ও ছাদের পাথর ঠাণ্ডা থাকে এবং মুসল্লীদের নামায পড়তে কোন কষ্ট হয় না। ছাদে ও দোতালায় সহজে উঠার জন্য স্বয়ংক্রিয় ৪টি বৈদ্যুতিক সিঁড়ি চালু করা হয়েছে। প্রতিঘন্টায় একটি সিঁড়ির পরিবহন ক্ষমতা হচ্ছে ৮ হাজার মুসল্লী। হজ্জ এবং রমযানের ভীষণ ভিড়ের সময় ছাদ ও স্বয়ংক্রিয় সিঁড়িগুলো ব্যবহার করা হয়। এতে অতিরিক্ত ৮০ হাজার মুসল্লীর নামাযের ব্যবস্থা হয়েছে। নারীদেরও ছাদে নামায পড়ার ব্যবস্থা আছে। ছাদকে নামাযের উপযোগী করে গড়ে তোলার জন্য ৩শ' মিলিয়ন রিয়াল ব্যয় হয়েছে। এছাড়াও বয়স্ক লোকদের দোতালায় উঠার জন্য বাবুস সাফায় ২টি, বাবে আবদুল আযীযে ১টি এবং অন্যদিকে আরো ৩টি বৈদ্যুতিক লিফট রয়েছে।

মসজিদে হারামের মাতাফ, হাজারে আসওয়াদ এবং রোকনে ইয়ামানী বরাবর দক্ষিণ দিকে বৃদ্ধির প্রয়োজনীয়তা অনুভব করে সে ব্যাপারে প্রয়োজনীয় ব্যবস্থা গ্রহণের চেষ্টা চলছে। কেননা, রমযান ও হজ্জের সময় ঐ দিকে প্রচণ্ড ভিড় হয় এবং তওয়াফকারীদের সংকুলান হয় না। অপর দিকে, গরমের সময় গোটা মসজিদে হারামে এয়ারকন্ডিশন চালু করার নির্দেশও দেয়া হয়েছে। এ ব্যাপারে প্রয়োজনীয় প্রস্তুতি চলছে। দোতালায় উঠার জন্য মাসআর ২টি সিঁড়িসহ সর্বমোট ১৩টি সাধারণ সিঁড়ি রয়েছে।

মসজিদে হারামের সব তলায় মূল্যবান কার্পেট বিছানো হয়েছে এবং প্রতিদিন তা পরিষ্কার করা হয়।

মসজিদে হারামে বর্তমানে ৩৬টি দরজা আছে। ৩৬টি দরজার মধ্যে ৫টি দরজা প্রায়ই বন্ধ থাকে এবং সেগুলো দিয়ে মসজিদে হারামে কোন লোক প্রবেশ কিংবা বের হয় না। এর মধ্যে তিনটা দরজা খুবই বড়। সেগুলো মসজিদে হারামের প্রধান দরজা। দরজাগুলোর নাম ও বর্ণনা নিম্নরূপ:

পূর্ব-দক্ষিণ দিক: ১। আযইয়াদ ২। বিলাল ৩। হোনাইন ৪। ইসমাঈল ৫। সাফা। এদিকে কোন দরজা নেই।

উত্তর-পূর্ব দিক: ১। দারুল আরকাম ২। বনি হাশেম ৩। আলী ৪। আব্বাস ৫। আন-নবী ৬। আস সালাম ৭। বনি শায়বা ৮। হুজুন ৯। মোয়াল্লাহ ১০। মোদ্দাআ ১১। মারওয়া। এদিকেও কোন প্রধান দরজা নেই।

মারওয়া থেকে বাবুল ফাতহ এর মাঝে ৫টি দরজা পড়ে। এগুলো সর্বদা বন্ধ থাকে। শুধু বাবে কোরাইশ মাঝে মাঝে খোলা থাকে। এদিকের দরজাগুলোর নাম হচ্ছেঃ ১। মুরাদ ২। মোহাসসাব ৩। আরাফাহ ৪। মিনা ৫। কোরাইশ।

পশ্চিম-উত্তর দিক: ১। আল-ফাতহ, প্রধান দরজা। এটি উত্তর-পূর্ব কোণে অবস্থিত। ২। উমর ফারুক ৩। নাদওয়াহ ৪। শামীয়াহ ৫। আল কুদস ৬। মদীনা মোনাওয়ারা ৭। হোদায়বিয়া ৮। উমরাহ। এটি একটি প্রধান দরজা এবং তা উত্তর-পশ্চিম কোণে অবস্থিত।

দক্ষিণ-পশ্চিম দিক: ১। শোবেকা ২। ইবরাহীম ৩। আবু বকর সিদ্দিক ৪। হিজরত ৫। আল-ওয়াদা ৬। উম্মেহানী ৭। বাবে আবদুল আযীয। এটি একটি প্রধান দরজা; এটি মসজিদে হারামের দক্ষিণ-পশ্চিম কোণে অবস্থিত। তিনটি প্রধান দরজার মধ্যে এটি প্রধান সড়কের সাথে জড়িত হওয়ায় এর গুরুত্ব অনেক বেশী। এই দরজা দিয়ে সরকারী মেহমান ও বেশী সংখ্যক লোক প্রবেশ করে। নতুন সম্প্রসারণের ৯টি দরজাসহ মসজিদে হারামের মোট দরজার সংখ্যা হচ্ছে ৪৫টি।

মসজিদে হারামের দোতলায় আরো ৪টি দরজা আছে। একটি হচ্ছে, মারওয়া পাহাড়ের উপর। বাইরের পাহাড়ের উপর দিয়ে তৈরি উঁচু রাস্তার সাথে এই দরজাটি সংযুক্ত। ফলে বাইরে থেকে ঐ রাস্তা ও দরজা দিয়ে মুসল্লীরা সরাসরি দোতলায় প্রবেশ করতে পারে। অন্য একটি দরজা হচ্ছে উত্তর-পশ্চিম দিকের দোতলার সাথে জড়িত। সেটিও পশ্চিম-উত্তর দিক থেকে আসা পাহাড়ী রাস্তার সাথে সংযুক্ত। আরেকটি দরজা হচ্ছে, উত্তর-পশ্চিম দিকে বাবে উমরাহর সাথে। সেটিও বাইরের উঁচু পাহাড়ী রাস্তার সাথে সংযুক্ত। মুসল্লীরা এই দরজা দিয়েও সরাসরি দোতলায় প্রবেশ করে।

এছাড়াও নীচতলা থেকে দোতলায় উঠার জন্য মোট ৭টা সিঁড়ি আছে। পূর্বে দরজাগুলোর বিভিন্ন নাম ছিল এবং দরজার সংখ্যাও কম ছিল। কিন্তু মসজিদ সম্প্রসারণের সাথে সাথে ক্রমান্বয়ে দরজা বেড়েছে এবং সেগুলোর নতুন নতুন নামকরণ করা হয়েছে। অনেক দরজার নামও পরিবর্তন করা হয়েছে।

মসজিদে হারামে অনেক স্তম্ভ আছে। এগুলোর উপর প্রথম তলাও দোতলার ছাদ দাঁড়িয়ে আছে। সেগুলো মার্বেল পাথরের তৈরি কিংবা মোজাইক করা। সেগুলোর গোড়া এবং মাথায় আশ্চর্য ধরনের কারুকার্য করা হয়েছে। মসজিদে হারামের ভিটি বেশ উঁচু-নীচু। মাতাফ হচ্ছে সর্বনিম্ন এবং মাতাফের উপরে ক্রমান্বয়ে স্তরে স্তরে উঁচু যমীন কেটে, সমান না করে, ভৌগোলিক বৈশিষ্ট্য অক্ষুণ্ণ রাখা হয়েছে।

মাটির নীচতলার মসজিদের আয়তন ১ম তলা থেকে কম। ১ম তলার সৌদী সম্প্রসারণ বরাবর নীচে একতলা নির্মাণ করা হয়েছে। তাও মসজিদের তিন দিকে মাত্র। উত্তর-পূর্ব দিকে নয়। বর্তমানে নীচতলা বন্ধ, এতে কেউ নামায পড়ে না। রমযান ও হজ্জের সময় নামাযের জন্য তা খুলে দেয়া হয়।